Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms