Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
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