Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms