Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms