Protein–RNA interactions for Protein: Q96HW7

INTS4, Integrator complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS4Q96HW7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
INTS4Q96HW7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms