Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
BCANQ96GW7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BCANQ96GW7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms