Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.58■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms