Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms