Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEURL3Q96EH8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms