Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms