Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIFAQ96CG3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms