Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 ARL6IP6-202ENST00000425034 465 ntTSL 22.62□□□□□ -1.994e-14■■■■■ 55.6
TBRG4Q969Z0 ARL6IP6-203ENST00000455875 479 ntTSL 22.15□□□□□ -2.074e-14■■■■■ 55.6
TBRG4Q969Z0 ARL6IP6-204ENST00000463690 1402 ntTSL 21.9□□□□□ -2.114e-14■■■■■ 55.6
TBRG4Q969Z0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 55.5
TBRG4Q969Z0 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 55.5
TBRG4Q969Z0 PLEKHA7-211ENST00000531066 4561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 55.5
TBRG4Q969Z0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 55.5
TBRG4Q969Z0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 55.5
TBRG4Q969Z0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 55.5
TBRG4Q969Z0 LDLRAD4-215ENST00000590371 598 ntTSL 218.02■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 55.5
TBRG4Q969Z0 SUMF1-204ENST00000448413 3150 ntTSL 214.04□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 55.5
TBRG4Q969Z0 SUMF1-203ENST00000405420 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 55.5
TBRG4Q969Z0 NAT10-210ENST00000615292 3329 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 55.5
TBRG4Q969Z0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 55.3
TBRG4Q969Z0 BTBD11-203ENST00000415943 723 ntTSL 518.76■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 55.3
TBRG4Q969Z0 BTBD11-207ENST00000550706 667 ntTSL 517.91■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 55.3
TBRG4Q969Z0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 55.3
TBRG4Q969Z0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 55.3
TBRG4Q969Z0 NUBPL-208ENST00000550649 557 ntTSL 518.61■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 55.2
TBRG4Q969Z0 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 55.2
TBRG4Q969Z0 NUBPL-203ENST00000547839 2001 ntTSL 28.3□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 55.2
TBRG4Q969Z0 NUBPL-210ENST00000551314 567 ntTSL 47.69□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 55.2
TBRG4Q969Z0 NUBPL-205ENST00000549838 556 ntTSL 51.78□□□□□ -2.122e-6■■■■■ 55.2
TBRG4Q969Z0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.885e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.85e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.445e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.435e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.415e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.385e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.295e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.175e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 TPCN2-204ENST00000535009 2175 ntTSL 222.18■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ATP10A-206ENST00000555815 6766 ntTSL 522.13■■□□□ 1.135e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.15e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 GDPD5-213ENST00000532435 825 ntTSL 521.83■■□□□ 1.095e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 XXYLT1-210ENST00000491138 738 ntTSL 321.66■■□□□ 1.065e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.045e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.045e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.955e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FDXR-208ENST00000578473 2482 ntTSL 1 (best)20.95■□□□□ 0.945e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.935e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.935e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.885e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.875e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.875e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 GAK-219ENST00000512325 577 ntTSL 320.47■□□□□ 0.875e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.865e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 POR-206ENST00000421059 631 ntTSL 420.44■□□□□ 0.865e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.845e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.835e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CBFA2T2-207ENST00000471007 712 ntTSL 220.11■□□□□ 0.815e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.815e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 AC098484.3-201ENST00000464081 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.09■□□□□ 0.815e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FDXR-206ENST00000577509 1912 ntTSL 220.08■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FDXR-218ENST00000583881 1561 ntTSL 220■□□□□ 0.795e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 OSBPL5-205ENST00000465323 674 ntTSL 220■□□□□ 0.795e-7■■■■■ 55
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TBRG4Q969Z0 XXYLT1-208ENST00000473200 698 ntTSL 219.88■□□□□ 0.775e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.765e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.745e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.745e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 EEF2KMT-208ENST00000587200 684 ntTSL 519.41■□□□□ 0.75e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.685e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 VCP-203ENST00000448530 950 ntTSL 519.2■□□□□ 0.665e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.665e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 OSBPL5-206ENST00000471998 2182 ntTSL 219.12■□□□□ 0.655e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 GAK-202ENST00000502656 554 ntTSL 419.09■□□□□ 0.655e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FDXR-209ENST00000579482 2157 ntTSL 219.01■□□□□ 0.635e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FDXR-216ENST00000582710 846 ntTSL 518.87■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 EEF2KMT-205ENST00000586444 996 ntTSL 318.75■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.585e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.575e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 XXYLT1-203ENST00000418940 582 ntTSL 418.48■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.475e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 EEF2KMT-207ENST00000587161 1282 ntTSL 517.92■□□□□ 0.465e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SLC25A17-211ENST00000443810 593 ntTSL 317.92■□□□□ 0.465e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.465e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 OSBPL5-212ENST00000528124 567 ntTSL 417.82■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 INPP5D-205ENST00000451407 2545 ntTSL 217.79■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SLC25A17-203ENST00000412879 561 ntTSL 417.48■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FDXR-211ENST00000579893 558 ntTSL 417.46■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 VCP-202ENST00000417448 722 ntTSL 317.4■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 TMEM8A-208ENST00000476735 801 ntTSL 517.38■□□□□ 0.375e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CIC-209ENST00000576505 1304 ntTSL 317.31■□□□□ 0.365e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 GDPD5-208ENST00000529095 1201 ntTSL 1 (best)17.27■□□□□ 0.365e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 POR-219ENST00000471238 600 ntTSL 317.11■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CD82-210ENST00000529277 582 ntTSL 516.99■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SLC25A17-214ENST00000458600 801 ntTSL 316.84■□□□□ 0.295e-7■■■■■ 55
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