Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM54Q969K7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms