Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF34Q969K3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms