Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BHMTQ93088 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BHMTQ93088 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
BHMTQ93088 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BHMTQ93088 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BHMTQ93088 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BHMTQ93088 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHMTQ93088 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHMTQ93088 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHMTQ93088 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHMTQ93088 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHMTQ93088 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BHMTQ93088 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BHMTQ93088 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BHMTQ93088 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHMTQ93088 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BHMTQ93088 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHMTQ93088 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BHMTQ93088 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BHMTQ93088 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHMTQ93088 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHMTQ93088 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHMTQ93088 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHMTQ93088 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BHMTQ93088 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHMTQ93088 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHMTQ93088 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHMTQ93088 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BHMTQ93088 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BHMTQ93088 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHMTQ93088 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BHMTQ93088 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BHMTQ93088 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHMTQ93088 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHMTQ93088 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BHMTQ93088 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHMTQ93088 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BHMTQ93088 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BHMTQ93088 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHMTQ93088 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BHMTQ93088 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHMTQ93088 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BHMTQ93088 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHMTQ93088 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BHMTQ93088 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BHMTQ93088 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BHMTQ93088 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHMTQ93088 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BHMTQ93088 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHMTQ93088 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BHMTQ93088 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHMTQ93088 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHMTQ93088 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHMTQ93088 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms