Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms