Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUBCNQ92622 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms