Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms