Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms