Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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