Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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TTC21AQ8NDW8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
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TTC21AQ8NDW8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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TTC21AQ8NDW8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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TTC21AQ8NDW8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
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