Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC24Q8N4L8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC24Q8N4L8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms