Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms