Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms