Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK2Q8IWQ3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRSK2Q8IWQ3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK2Q8IWQ3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK2Q8IWQ3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK2Q8IWQ3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK2Q8IWQ3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK2Q8IWQ3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK2Q8IWQ3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK2Q8IWQ3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK2Q8IWQ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms