Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms