Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGA4Q8IV77 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA4Q8IV77 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA4Q8IV77 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA4Q8IV77 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA4Q8IV77 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms