Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALYREFQ86V81 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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