Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3Q7Z739 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms