Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms