Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms