Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
H2AFVQ71UI9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms