Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q71RC1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q71RC1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q71RC1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q71RC1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q71RC1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q71RC1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q71RC1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q71RC1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q71RC1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q71RC1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q71RC1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q71RC1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q71RC1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q71RC1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q71RC1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q71RC1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q71RC1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q71RC1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q71RC1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q71RC1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q71RC1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms