Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAD11Q709F0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms