Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms