Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN5

FOXI2, Forkhead box protein I2, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI2Q6ZQN5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXI2Q6ZQN5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXI2Q6ZQN5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXI2Q6ZQN5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXI2Q6ZQN5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXI2Q6ZQN5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms