Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms