Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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