Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3EQ6PEY2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3EQ6PEY2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms