Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAVIN1Q6NZI2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms