Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms