Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms