Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms