Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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LCN8Q6JVE9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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LCN8Q6JVE9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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LCN8Q6JVE9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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