Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms