Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A4Q6AI14 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms