Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNS3Q68CZ2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms