Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9BQ674R7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms