Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RPRD2Q5VT52 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RPRD2Q5VT52 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms