Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01545Q5VT33 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms